Sim. Tomar a pílula do dia seguinte uma vez, provavelmente, não afetará nem na quantidade nem na qualidade do leite materno. Apesar que que alguns hormônios podem passar através do leite materno, é provável que seu filho não experimente nenhum efeito adverso. Entretanto, a etiqueta informa que não deve ser utilizada por mães amamentando já que não se sabe se pode trazer riscos para o bebê.
De toda forma, dificilmente você precisaria recorrer às pílulas de emergência, já que mesmo que tenha tido relações sexuais, é improvável que uma mulher engravide durante os seis primeiros meses de ter o bebê já que é pouco provável que ovule se está alimentando seu bebê exclusivamente com leite materno e não teve seu período menstrual desde o parto.
Caso esse já não seja o seu caso, melhor é conversar com seu médico para que possa prescrever um anticoncepcional adequado para você. Essa é melhor maneira de evitar uma gravidez não desejada.